Детектив Конан: На перекрёстках древней столицы

Под покровом ночи замаскированный самурай убивает пятерых мужчин в разных уголках Японии: троих в Токио, одного в Осаке и последнего в Киото. В ходе расследования полиция выясняет, что все жертвы состояли в банде «Гэндзиботару» - группировке воров, специализирующейся на краже буддийских статуй и артефактов. Члены банды носят имена слуг Минамото-но Ёсицунэ. Следствие не имеет ни ясного мотива, ни зацепок насчёт личностей остальных участников группы, поэтому дело заходит в тупик. Один из храмов Киото обращается за помощью к знаменитому детективу Когоро Мори. Монахи получили анонимное письмо с необычной головоломкой и просят разгадать её, чтобы вернуть давно утраченную статую.

Параллельно Конан Эдогава и юный детектив Хэйджи Хаттори объединяют усилия, чтобы найти убийцу. Хаттори также разыскивает свою возлюбленную детства, и его знание улочек Киото помогает парням прочёсывать город и постепенно приближаться к истине. Убийца наносит новый удар, расправляясь ещё с одним членом «Гэндзиботару». После нескольких неудачных покушений на Хаттори преступник похищает его возлюбленную. Конан и Хаттори раскрывают скрытые улики, объединяют все имеющиеся данные и выходят на след самурая-мстителя, чтобы остановить его и спасти похищенную девушку.