Дневник будущего: Повторный набор

События разворачиваются после завершения оригинального сериала. Главные герои, хранители дневников, возвращаются в сюжет. Деус, известный как Deus Ex Machina, продолжает испытывать трудности с выбором нового бога, хотя время на это решение почти исчерпано. Эта проблема становится центральной для дальнейшего развития истории.

Юно Гасай из третьего мира начинает видеть воспоминания Юно из первого мира. Она живет с ощущением утраты чего-то значимого, но не может определить, что именно потеряно. Это вызывает у нее беспокойство. Дальнейшие события зависят от того, вспомнит ли она прошлое: это может привести к началу новой игры, к концу или к иному исходу.