Парень из эпохи Бакумацу

История происходит в эпоху Бакумацу. Синсаку Такасуги, наёмник из Тёсю, вместе со своим товарищем Когоро Кацурой проникает на государственный корабль. Они разыскивают хронометр - артефакт, способный изменять время. Такасуги опасается, что правительство завладеет им и использует силу артефакта в своих интересах, поэтому планирует уничтожить находку. Когда хронометр оказывается у напарников, его похищает неизвестный вор. Синсаку и Когоро отправляются за ним в погоню и следуют до резиденции правительства в Киото, рассчитывая вернуть артефакт и довести задуманное до конца.

По прибытии в столицу выясняется, что правительство свергнуто. Город находится под властью божества Сусаноо, а прежние государственные структуры перестали существовать. Улицы Киото и его жители сильно изменились по сравнению с тем, что помнят герои. Несмотря на это, Синсаку и Когоро сохраняют первоначальную миссию: они намерены перезапустить время, чтобы вернуть прежний порядок и не допустить захвата страны силами, которые установили своё правление в этих землях.