Утраченное небесами: Мой хозяин навсегда

Сюжет фильма разворачивается после событий первой части. Томоки Сакурай сталкивается с последствиями контакта с ангелоидами, которые остались в его мире. Повседневная жизнь героя и его окружения нарушается появлением новых аномалий, связанных с технологиями небесной цивилизации. Вместе с Икарос, Нимпф и Астреей Томоки пытается разобраться в происходящем. Ситуация осложняется тем, что часть ангелоидов переходит на сторону враждебных сил, а их мотивы остаются неясными до последнего момента.

Развитие событий приводит к прямому столкновению между группами ангелоидов. Томоки и его друзья вынуждены участвовать в конфликте, который затрагивает судьбу как их собственного мира, так и небесной структуры, откуда прибыли ангелоиды. Героям приходится выяснить, какая сила управляет ангелоидами и какая цель преследуется их создателями. Финал дилогии подводит черту под историей Томоки, его друзей и ангелоидов, определяя дальнейшее сосуществование двух миров.