Воины-марионетки от Джей до Икс

События разворачиваются спустя несколько месяцев после окончания OVA-сериала «Воины-марионетки Джей». Отару Мамия продолжает жить вместе со своими марионетками Лайм, Черри и Бладберри. В это время Гельхардт фон Фауст возвращается и возобновляет эксперименты с технологией создания марионеток. Его работы представляют опасность, так как затрагивают области, которые ранее старались не использовать.

В конфликт оказываются вовлечены Сабер-куклы. Они испытывают противоречивые чувства: симпатию к Отару и одновременно верность Фаусту. Перед Отару и его марионетками стоит задача остановить Фауста. От результата их действий зависит, смогут ли они сохранить себя или будут уничтожены.