С начала, если...

В альтернативной версии событий аниме «С начала. Часть II» персонаж Нэму погибает. После её смерти Дзюнъити пытается подвести черту и вернуться к обычной жизни. Он сосредоточивается на будничных делах и постепенно привыкает к мысли, что нужно двигаться дальше. В этом процессе значительную роль играет Котори, которая находится рядом и предлагает начать новые отношения. Дзюнъити принимает её поддержку, но внутренне ещё не до конца готов отказаться от воспоминаний о прошлом. Его попытки адаптироваться к изменившимся обстоятельствам составляют основу сюжета данной версии.

По мере развития событий выясняется, что смерть Нэму имела обстоятельства, о которых Дзюнъити не знал или не придавал им значения. Это открытие заставляет его пересмотреть своё отношение к произошедшему и к людям, которые его окружают. Взаимодействие с Котори перестаёт быть простым способом уйти от боли - оно становится поводом для более глубокого анализа собственных чувств и мотивов. Прошлое продолжает влиять на решения главного персонажа, и финал этой альтернативной истории зависит от того, сможет ли он примирить память о Нэму с возможностью нового начала.